為快速找到有效抑制新冠病毒的活性成分,世界各地的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)正通過(guò)細(xì)胞培養(yǎng)測(cè)試已批準(zhǔn)的病毒類藥物的有效性,雖然這些藥物已用于治療其他病毒性疾病,但可能對(duì)新冠病毒作用有限,因此還有必要尋找活性成分的改進(jìn)衍生物。為此,巴斯夫研究人員對(duì)公司內(nèi)部包含數(shù)百萬(wàn)種分子的物質(zhì)庫(kù)進(jìn)行了計(jì)算機(jī)輔助搜索,以尋找類似的化合物,并最終確定了150種有希望的候選化合物。巴斯夫免費(fèi)向各大學(xué)術(shù)工作團(tuán)隊(duì)提供這些化合物,并允許其用于研究,無(wú)需支付任何專利費(fèi)。
來(lái)自計(jì)算化學(xué)部的化學(xué)家們同時(shí)開(kāi)始了另一條尋找活性成分的途徑,即利用計(jì)算化學(xué)的知識(shí)幫助篩查活性組分。他們得知一家生物技術(shù)公司PostEra正開(kāi)展一項(xiàng)名為COVID Moonshot的項(xiàng)目,該項(xiàng)目通過(guò)來(lái)自全球的科學(xué)家志愿者尋找新冠病毒主蛋白酶的抑制劑,阻止病毒在人體內(nèi)自我復(fù)制。巴斯夫研究人員也加入其中,共同尋找有效抑制劑,在巴斯夫內(nèi)部開(kāi)發(fā)的計(jì)算機(jī)程序和超級(jí)計(jì)算機(jī)Quriosity的幫助下設(shè)計(jì)出許多新型分子。
最終,他們通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬找到了20個(gè)最適合主蛋白酶活性位點(diǎn)的分子,并將相關(guān)分子信息免費(fèi)提供給該項(xiàng)目,作進(jìn)一步研究。
巴斯夫數(shù)字生物科學(xué)研究部的計(jì)算化學(xué)主任Klaus-Jürgen Schleifer教授解釋道:然而,這些通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬得來(lái)的分子,我們并不確定它們能否被準(zhǔn)確合成。”
為此,巴斯夫研究人員也在嘗試第三種尋找活性成分的方法:借助超級(jí)計(jì)算機(jī),對(duì)一家COVID Moonshot項(xiàng)目的合約制造商理論上可以合成的所有化合物進(jìn)行效能測(cè)試。可能的化合物多達(dá)約12億種,巴斯夫團(tuán)隊(duì)就其抑制新冠病毒主蛋白酶的潛力進(jìn)行一一計(jì)算。這種篩查方法的好處是,所有篩查下來(lái)的的活性分子都可以快速合成,然后在實(shí)驗(yàn)中接受測(cè)試。巴斯夫?qū)⑼ㄟ^(guò)COVID Moonshot項(xiàng)目公開(kāi)這些結(jié)果。
巴斯夫擁有自己的超級(jí)計(jì)算機(jī)Quriosity,并開(kāi)發(fā)了自己的計(jì)算機(jī)程序用于分子設(shè)計(jì)。此次巴斯夫充分發(fā)揮強(qiáng)大的研究能力,通過(guò)多種方式幫助尋找病毒解藥,為抗擊新冠疫情貢獻(xiàn)一份力量。